Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGSM3Q96HU1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGSM3Q96HU1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGSM3Q96HU1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms