Protein–RNA interactions for Protein: Q96HM7

PCED1B, PC-esterase domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCED1BQ96HM7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCED1BQ96HM7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCED1BQ96HM7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCED1BQ96HM7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCED1BQ96HM7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCED1BQ96HM7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCED1BQ96HM7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCED1BQ96HM7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCED1BQ96HM7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCED1BQ96HM7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCED1BQ96HM7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCED1BQ96HM7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCED1BQ96HM7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCED1BQ96HM7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCED1BQ96HM7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCED1BQ96HM7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCED1BQ96HM7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCED1BQ96HM7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCED1BQ96HM7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms