Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPNQ96H22 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CENPNQ96H22 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CENPNQ96H22 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1013.7 ms