Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
STAMBPL1Q96FJ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms