Protein–RNA interactions for Protein: Q96F85

CNRIP1, CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNRIP1Q96F85 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNRIP1Q96F85 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNRIP1Q96F85 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNRIP1Q96F85 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms