Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MVB12AQ96EY5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MVB12AQ96EY5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MVB12AQ96EY5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms