Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ0

SGTB, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTBQ96EQ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SGTBQ96EQ0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SGTBQ96EQ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms