Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39LQ96EH5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39LQ96EH5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39LQ96EH5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms