Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ELP4Q96EB1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ELP4Q96EB1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELP4Q96EB1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms