Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MS4A6EQ96DS6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A6EQ96DS6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A6EQ96DS6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A6EQ96DS6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms