Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHBDF1Q96CC6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDF1Q96CC6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDF1Q96CC6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms