Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPTSSAQ969W0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SPTSSAQ969W0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPTSSAQ969W0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms