Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP7Q93009 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP7Q93009 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP7Q93009 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP7Q93009 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP7Q93009 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP7Q93009 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP7Q93009 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP7Q93009 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP7Q93009 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP7Q93009 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP7Q93009 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP7Q93009 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP7Q93009 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP7Q93009 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP7Q93009 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP7Q93009 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP7Q93009 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP7Q93009 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP7Q93009 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP7Q93009 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP7Q93009 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP7Q93009 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP7Q93009 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP7Q93009 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP7Q93009 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP7Q93009 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP7Q93009 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP7Q93009 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP7Q93009 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP7Q93009 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP7Q93009 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP7Q93009 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP7Q93009 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP7Q93009 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP7Q93009 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP7Q93009 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP7Q93009 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP7Q93009 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP7Q93009 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP7Q93009 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP7Q93009 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP7Q93009 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP7Q93009 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP7Q93009 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP7Q93009 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP7Q93009 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP7Q93009 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP7Q93009 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP7Q93009 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP7Q93009 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP7Q93009 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP7Q93009 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP7Q93009 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP7Q93009 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP7Q93009 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP7Q93009 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP7Q93009 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP7Q93009 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP7Q93009 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP7Q93009 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP7Q93009 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP7Q93009 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP7Q93009 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP7Q93009 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP7Q93009 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP7Q93009 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP7Q93009 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP7Q93009 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP7Q93009 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP7Q93009 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP7Q93009 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP7Q93009 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP7Q93009 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP7Q93009 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP7Q93009 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP7Q93009 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP7Q93009 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP7Q93009 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP7Q93009 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP7Q93009 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP7Q93009 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP7Q93009 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP7Q93009 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP7Q93009 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP7Q93009 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP7Q93009 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP7Q93009 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP7Q93009 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP7Q93009 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP7Q93009 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP7Q93009 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP7Q93009 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP7Q93009 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP7Q93009 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP7Q93009 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP7Q93009 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP7Q93009 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP7Q93009 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP7Q93009 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms