Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTPRUQ92729 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PTPRUQ92729 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PTPRUQ92729 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PTPRUQ92729 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms