Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RGP1Q92546 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RGP1Q92546 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RGP1Q92546 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms