Protein–RNA interactions for Protein: Q92529

SHC3, SHC-transforming protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC3Q92529 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHC3Q92529 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHC3Q92529 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHC3Q92529 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms