Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWG9

KCNE4, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 4, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNE4Q8WWG9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNE4Q8WWG9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNE4Q8WWG9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNE4Q8WWG9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNE4Q8WWG9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNE4Q8WWG9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNE4Q8WWG9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNE4Q8WWG9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNE4Q8WWG9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNE4Q8WWG9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNE4Q8WWG9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNE4Q8WWG9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNE4Q8WWG9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNE4Q8WWG9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNE4Q8WWG9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNE4Q8WWG9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNE4Q8WWG9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNE4Q8WWG9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNE4Q8WWG9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNE4Q8WWG9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNE4Q8WWG9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNE4Q8WWG9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNE4Q8WWG9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms