Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCFD1Q8WVM8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCFD1Q8WVM8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCFD1Q8WVM8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCFD1Q8WVM8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCFD1Q8WVM8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCFD1Q8WVM8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCFD1Q8WVM8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCFD1Q8WVM8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCFD1Q8WVM8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms