Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLHC1Q8NHS4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLHC1Q8NHS4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLHC1Q8NHS4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms