Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM58Q8NG06 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM58Q8NG06 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM58Q8NG06 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM58Q8NG06 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms