Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP43Q8NFH3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP43Q8NFH3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP43Q8NFH3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms