Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MCPH1Q8NEM0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MCPH1Q8NEM0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MCPH1Q8NEM0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.1 ms