Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND25

ZNRF1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF1Q8ND25 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRF1Q8ND25 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF1Q8ND25 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms