Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RDH13Q8NBN7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RDH13Q8NBN7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RDH13Q8NBN7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RDH13Q8NBN7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RDH13Q8NBN7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RDH13Q8NBN7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RDH13Q8NBN7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RDH13Q8NBN7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RDH13Q8NBN7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RDH13Q8NBN7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RDH13Q8NBN7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RDH13Q8NBN7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RDH13Q8NBN7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RDH13Q8NBN7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms