Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTC29Q8NA56 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC29Q8NA56 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TTC29Q8NA56 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms