Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U9

BMPER, BMP-binding endothelial regulator protein, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMPERQ8N8U9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BMPERQ8N8U9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BMPERQ8N8U9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BMPERQ8N8U9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BMPERQ8N8U9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms