Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBR7Q8N806 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBR7Q8N806 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBR7Q8N806 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBR7Q8N806 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR7Q8N806 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms