Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R7

CCNYL1, Cyclin-Y-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL1Q8N7R7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNYL1Q8N7R7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNYL1Q8N7R7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNYL1Q8N7R7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNYL1Q8N7R7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNYL1Q8N7R7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNYL1Q8N7R7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNYL1Q8N7R7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNYL1Q8N7R7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNYL1Q8N7R7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNYL1Q8N7R7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNYL1Q8N7R7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNYL1Q8N7R7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNYL1Q8N7R7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNYL1Q8N7R7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYL1Q8N7R7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms