Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
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TMCO5AQ8N6Q1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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TMCO5AQ8N6Q1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMCO5AQ8N6Q1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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TMCO5AQ8N6Q1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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TMCO5AQ8N6Q1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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TMCO5AQ8N6Q1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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TMCO5AQ8N6Q1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCO5AQ8N6Q1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCO5AQ8N6Q1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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