Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN19Q8N6F1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN19Q8N6F1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN19Q8N6F1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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