Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM20Q8N5G0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM20Q8N5G0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SMIM20Q8N5G0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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