Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LNX2Q8N448 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LNX2Q8N448 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LNX2Q8N448 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms