Protein–RNA interactions for Protein: Q8N350

CBARP, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBARPQ8N350 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBARPQ8N350 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CBARPQ8N350 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBARPQ8N350 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms