Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 SPIRE1-213ENST00000592156 863 ntTSL 34.37□□□□□ -1.713e-8■■■■■ 40
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AGGF1Q8N302 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.124e-9■■■■■ 40
AGGF1Q8N302 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.194e-9■■■■■ 40
AGGF1Q8N302 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.194e-9■■■■■ 40
AGGF1Q8N302 GFI1B-201ENST00000339463 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.564e-9■■■■■ 40
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AGGF1Q8N302 PRPF40B-216ENST00000552301 912 ntTSL 518.03■□□□□ 0.485e-8■■■■■ 39.9
AGGF1Q8N302 PRPF40B-211ENST00000551063 531 ntTSL 415.04■□□□□ -05e-8■■■■■ 39.9
AGGF1Q8N302 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 39.9
AGGF1Q8N302 NGEF-208ENST00000461944 568 ntTSL 418.47■□□□□ 0.557e-11■■■■■ 39.9
AGGF1Q8N302 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 39.9
AGGF1Q8N302 NGEF-207ENST00000424488 569 ntTSL 313.78□□□□□ -0.27e-11■■■■■ 39.9
AGGF1Q8N302 MNAT1-201ENST00000261245 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.376e-9■■■■■ 39.9
AGGF1Q8N302 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.676e-9■■■■■ 39.9
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AGGF1Q8N302 LINC00963-207ENST00000454635 910 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.776e-9■■■■■ 39.9
AGGF1Q8N302 MNAT1-209ENST00000557134 680 ntTSL 39.85□□□□□ -0.836e-9■■■■■ 39.9
AGGF1Q8N302 PPP4R1-207ENST00000578010 558 ntTSL 36.59□□□□□ -1.358e-17■■■■■ 39.9
AGGF1Q8N302 MNAT1-204ENST00000554002 616 ntTSL 36.45□□□□□ -1.386e-9■■■■■ 39.9
AGGF1Q8N302 TDH-204ENST00000534302 1421 ntTSL 216.4■□□□□ 0.227e-7■■■■■ 39.8
AGGF1Q8N302 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.017e-7■■■■■ 39.8
AGGF1Q8N302 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.037e-7■■■■■ 39.8
AGGF1Q8N302 TDH-202ENST00000525664 935 ntTSL 1 (best)14.85□□□□□ -0.037e-7■■■■■ 39.8
AGGF1Q8N302 SHANK2-220ENST00000608988 1879 ntTSL 523.91■■□□□ 1.421e-7■■■■■ 39.8
AGGF1Q8N302 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.83e-7■■■■■ 39.8
AGGF1Q8N302 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.842e-10■■■■■ 39.8
AGGF1Q8N302 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.582e-10■■■■■ 39.8
AGGF1Q8N302 WDR25-210ENST00000557502 803 ntTSL 515.57■□□□□ 0.082e-10■■■■■ 39.8
AGGF1Q8N302 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.042e-10■■■■■ 39.8
AGGF1Q8N302 WDR25-208ENST00000555775 705 ntTSL 515.29■□□□□ 0.042e-10■■■■■ 39.8
AGGF1Q8N302 WDR25-211ENST00000557710 1751 ntTSL 1 (best)14.91□□□□□ -0.022e-10■■■■■ 39.8
AGGF1Q8N302 WDR25-209ENST00000555865 739 ntTSL 314.51□□□□□ -0.092e-10■■■■■ 39.8
AGGF1Q8N302 WDR25-206ENST00000554998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.332e-10■■■■■ 39.8
AGGF1Q8N302 WDR25-207ENST00000555201 652 ntTSL 311.71□□□□□ -0.532e-10■■■■■ 39.8
AGGF1Q8N302 RIN3-203ENST00000553959 687 ntTSL 320.18■□□□□ 0.828e-9■■■■■ 39.7
AGGF1Q8N302 RIN3-206ENST00000555589 2814 ntTSL 1 (best)16.57■□□□□ 0.248e-9■■■■■ 39.7
AGGF1Q8N302 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.028e-9■■■■■ 39.7
AGGF1Q8N302 RIN3-202ENST00000418924 3592 ntTSL 214.67□□□□□ -0.068e-9■■■■■ 39.7
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AGGF1Q8N302 RIN3-210ENST00000556418 4079 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.25□□□□□ -0.298e-9■■■■■ 39.7
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AGGF1Q8N302 CYP4V2-203ENST00000507209 8646 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ -03e-11■■■■■ 39.6
AGGF1Q8N302 RCSD1-204ENST00000472038 1719 ntTSL 219.37■□□□□ 0.694e-11■■■■■ 39.5
AGGF1Q8N302 RCSD1-201ENST00000361496 822 ntTSL 319.2■□□□□ 0.664e-11■■■■■ 39.5
AGGF1Q8N302 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.174e-11■■■■■ 39.5
AGGF1Q8N302 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.114e-11■■■■■ 39.5
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AGGF1Q8N302 PKD1L2-203ENST00000525539 7379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.594e-11■■■■■ 39.5
AGGF1Q8N302 TCF20-204ENST00000515426 633 ntTSL 516.29■□□□□ 0.28e-7■■■■■ 39.5
AGGF1Q8N302 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.287e-8■■■■■ 39.4
AGGF1Q8N302 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.74e-7■■■■■ 39.4
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AGGF1Q8N302 CLMN-203ENST00000555336 718 ntTSL 56.11□□□□□ -1.438e-9■■■■■ 39.3
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AGGF1Q8N302 ZFP64-212ENST00000477786 909 ntTSL 513.83□□□□□ -0.28e-8■■■■■ 39
AGGF1Q8N302 ZFP64-202ENST00000346617 2876 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.418e-8■■■■■ 39
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AGGF1Q8N302 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.684e-7■■■■■ 38.8
AGGF1Q8N302 ODF3L2-203ENST00000591681 534 ntTSL 213.83□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 38.8
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AGGF1Q8N302 ADGRG1-207ENST00000561872 534 ntTSL 414.86□□□□□ -0.036e-7■■■■■ 38.6
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AGGF1Q8N302 ADGRG1-249ENST00000566778 555 ntTSL 314.83□□□□□ -0.046e-7■■■■■ 38.6
AGGF1Q8N302 ADGRG1-251ENST00000567154 690 ntTSL 214.53□□□□□ -0.086e-7■■■■■ 38.6
AGGF1Q8N302 ADGRG1-247ENST00000566271 944 ntTSL 514.49□□□□□ -0.096e-7■■■■■ 38.6
AGGF1Q8N302 ADGRG1-221ENST00000563374 568 ntTSL 414.49□□□□□ -0.096e-7■■■■■ 38.6
AGGF1Q8N302 ADGRG1-212ENST00000562414 487 ntTSL 414.16□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 38.6
AGGF1Q8N302 ADGRG1-226ENST00000564103 558 ntTSL 413.85□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 38.6
AGGF1Q8N302 ADGRG1-262ENST00000568618 554 ntTSL 413.8□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 38.6
AGGF1Q8N302 ADGRG1-222ENST00000563414 586 ntTSL 413.42□□□□□ -0.266e-7■■■■■ 38.6
AGGF1Q8N302 ADGRG1-263ENST00000568645 896 ntTSL 313.33□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 38.6
AGGF1Q8N302 ADGRG1-233ENST00000564912 841 ntTSL 512.79□□□□□ -0.366e-7■■■■■ 38.6
AGGF1Q8N302 ADGRG1-277ENST00000570044 553 ntTSL 212.79□□□□□ -0.366e-7■■■■■ 38.6
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AGGF1Q8N302 ADGRG1-206ENST00000561833 937 ntTSL 412.79□□□□□ -0.366e-7■■■■■ 38.6
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AGGF1Q8N302 ADGRG1-254ENST00000567702 593 ntTSL 412.53□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 38.6
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