Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00528Q8N1L1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00528Q8N1L1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms