Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDKL3Q8IVW4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDKL3Q8IVW4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDKL3Q8IVW4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms