Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GATAD2AQ86YP4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATAD2AQ86YP4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATAD2AQ86YP4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATAD2AQ86YP4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATAD2AQ86YP4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATAD2AQ86YP4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATAD2AQ86YP4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATAD2AQ86YP4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GATAD2AQ86YP4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GATAD2AQ86YP4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATAD2AQ86YP4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms