Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF13Q86YI8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF13Q86YI8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF13Q86YI8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHF13Q86YI8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF13Q86YI8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF13Q86YI8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF13Q86YI8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHF13Q86YI8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF13Q86YI8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF13Q86YI8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF13Q86YI8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF13Q86YI8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHF13Q86YI8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF13Q86YI8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF13Q86YI8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF13Q86YI8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms