Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HAPLN4Q86UW8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HAPLN4Q86UW8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HAPLN4Q86UW8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HAPLN4Q86UW8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HAPLN4Q86UW8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HAPLN4Q86UW8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HAPLN4Q86UW8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HAPLN4Q86UW8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HAPLN4Q86UW8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HAPLN4Q86UW8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HAPLN4Q86UW8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HAPLN4Q86UW8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HAPLN4Q86UW8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HAPLN4Q86UW8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HAPLN4Q86UW8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms