Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCGF5Q86SE9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCGF5Q86SE9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCGF5Q86SE9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms