Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF550Q7Z398 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF550Q7Z398 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF550Q7Z398 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms