Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SV2AQ7L0J3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SV2AQ7L0J3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms