Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC24A5Q71RS6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC24A5Q71RS6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC24A5Q71RS6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC24A5Q71RS6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms