Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMUB2Q71RG4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMUB2Q71RG4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TMUB2Q71RG4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms