Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2R2Q712K3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBE2R2Q712K3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2R2Q712K3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2R2Q712K3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2R2Q712K3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2R2Q712K3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBE2R2Q712K3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBE2R2Q712K3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2R2Q712K3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2R2Q712K3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms