Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HACD2Q6Y1H2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD2Q6Y1H2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD2Q6Y1H2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms