Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPTNQ6XPR3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPTNQ6XPR3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPTNQ6XPR3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms