Protein–RNA interactions for Protein: Q6VN20

RANBP10, Ran-binding protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP10Q6VN20 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RANBP10Q6VN20 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RANBP10Q6VN20 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RANBP10Q6VN20 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RANBP10Q6VN20 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms