Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI9

NPNT, Nephronectin, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPNTQ6UXI9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPNTQ6UXI9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPNTQ6UXI9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPNTQ6UXI9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms