Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCIMPQ6UWF3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SCIMPQ6UWF3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCIMPQ6UWF3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms